L’adaptation au changement climatique, comme l’augmentation des périodes de sécheresse, constitue un défi majeur de l’agriculture tropicale et tempérée mondiale.
Une meilleure connaissance des mécanismes biologiques impliqués dans la réponse des plantes aux stress environnementaux, la caractérisation de la variabilité des réponses au sein de collections existantes ou nouvelles sont essentielles au Cirad (Centre international de coopération internationale en recherche agricole pour le développement) afin de créer de nouvelles variétés capables de mieux adaptés au changement climatique (CC) comme des températures plus élevées et des sécheresses plus fréquentes.
Afin de répondre aux besoins des caféiculteurs et aux demandes de la filière café, l’UMR DIADE mène des recherches sur les deux principales espèces commerciales de café (Robusta et Arabica) pour identifier, créer et propager des plantes plus résistantes à déficits hydriques. Ces recherches sont menées dans le cadre de 2 projets financés par l’Union européenne, en partenariat avec les centres de recherche publics de plusieurs pays producteurs de café (Vietnam, Ouganda, Nicaragua, Brésil, etc.) et le secteur privé. Ils concernent principalement :
• la mise en place et le suivi d’expérimentations en milieu contrôlé (serre), semi-contrôlé (maison en filet) ou au champ permettant le phénotypage de ces plantes pour la résistance à la sécheresse,
• identification de gènes candidats (CG) ou de marqueurs nucléiques (par les approches RNAseq, GS et GWAS) impliqués dans le déterminisme génétique de la tolérance à la sécheresse,
• validation de la fonction de ces CG par des approches de génomique fonctionnelle et de multiplication végétative de plantes d’intérêt.
Dans ce contexte, le Cirad recrute pour l’UMR DIADE, un chercheur en physiologie moléculaire ayant une expérience dans l’étude des mécanismes d’adaptation des plantes en réponse aux stress abiotiques, notamment la sécheresse. La personne recrutée aura les objectifs suivants :
• identifier les clones de Robusta résistants à la sécheresse par la mise en place et le suivi d’expérimentations (en conditions contrôlées et au champ) dans le cadre du
Projet DESIRA ROBUST (https://eastafricacoffee.org/) en partenariat avec NaCORI (National Coffee Research Institute-Kampala),
• participer aux recherches sur la génomique fonctionnelle du caféier, notamment l’identification des CG impliqués dans la tolérance à la sécheresse, le fonctionnement et l’architecture du système racinaire, à travers l’étude des données transcriptomiques (RNAseq.) et l’utilisation des données génomiques disponibles sur les plants de café, dans le cadre du projet Horizon Europe BOLERO,
• suivre les deux projets en Ouganda en concertation avec leurs coordinateurs CIRAD.
Détails de l’emplacement :
Montpellier (5 mois) puis Ouganda NaCORI & NARO (Kampala – Ouganda)
Chercheur spécialisé dans l’étude des réponses des plantes aux stress tests abiotiques avec :
• Doctorat / PhD en biologie moléculaire et cellulaire végétale ou PhD en physiologie moléculaire végétale
• si possible complété par un stage post-doctoral ou une expérience professionnelle plus longue (dans ce cas le salaire sera plus élevé)
Compétences spécifiques souhaitées :
• connaissance approfondie des mécanismes moléculaires et biologiques à l’œuvre chez les plantes en réponse à un stress abiotique ; une spécialisation en stress hydrique chez les plantes serait un plus
• connaissance approfondie du traitement des données nucléiques pour les analyses d’expression (RNAseq) et les études du génome (BLAST, FASTA, etc.)
• expérience requise dans la conception, la mise en place et le suivi de dispositifs expérimentaux en conditions semi-contrôlées (serre) et sur le terrain pour l’étude des réponses des plantes (de préférence grandes cultures) aux stress abiotiques
• connaissance des équipements scientifiques de phénotypage des plantes soumises à ces stress et suivi de l’application des conditions de stress
• expérience en transport le phénotypage visuel des plantes en conditions de stress
• très bonne connaissance de la gestion des données et du traitement statistique (de préférence gestion de logiciels)
• très bonne maîtrise de l’anglais (oral, écrit)
• capacité à travailler et à communiquer au sein d’une équipe multidisciplinaire et dans un environnement multiculturel (et en partenariat)
• capacité à rédiger articles scientifiques et rédaction de projets de recherche
• aptitude à encadrer des étudiants
• adaptable, motivé, indépendant et rigoureux
Vous bénéficierez d’allocations spécifiques de mobilité géographique, en fonction de la localisation et de la composition familiale. Vous recevrez environ 40 % de plus que votre salaire de base en France. Vous bénéficierez également d’une assurance sociale complète, quel que soit votre lieu de résidence. Aide au logement (loyer), électricité, eau, etc.
Date de clôture : 15/09/2023